L’origine del convento risale alla seconda metà del 1400, quando l’abate di Scalocchio offrì il sito e l’edificio ai Frati minori osservanti, già presenti all’Eremo di Buon Riposo. Il Papa Sisto IV diede l’approvazione nel 1474 e vi contribuì personalmente. Il p. Agostino da Stroncone scriveva in “Umbria Serafica”:

«L’Abate di Scalocchia dà il sito ed edifitio per i Minori Osservanti, in un luogo detto S. Susanna. Vi si fabbrica il convento S. Giovanni Battista a spese dei cittadini».

Nel 1913 il Vescovo Carlo Liviero affidava la Parrocchia di S. Pietro di Garavelle in perpetuo ai Frati Minori di S. Giovanni Battista in Città di Castello. Nel 1920 la parrocchia venne trasferita nella chiesa del suddetto convento. La parrocchia “S. Pietro di Garavelle in San Giovanni Battista” verrà nuovamente denominata San Giovanni Battista nel 1986 con l’ultima revisione concordataria.

Edificata sulle fondamenta di un preesistete edificio, la chiesa che sorge nella località denominata Zoccolanti ed è orientata verso est. La facciata inglobata nell’edifico che ospita il convento, è “nascosta” da un ampio portico che sorregge la sovrastante galleria. La facciata viene comunque evidenziata dalla grande apertura vetrata, con arco a tuto sesto, che sovrasta il portale d’ingresso posto sotto al porticato. Altro elemento che denuncia la presenza della chiesa è il tetto a doppio spiovente posto in asse con l’ingresso e la grande vetrata. L’alta torre campanaria a base quadrata che si innesta sul fianco sinistro dell’edificio è realizzata interamente in mattoni. Internamente la chiesa si sviluppa in una unica aula coperta da volte a crociera. In prossimità dell’ingresso sulla sinistra si apre una piccola cappella anch’essa formata da una unica sala coperta da volte a crociera. Il presbiterio rialzato di due gradini ha sullo sfondo un’abside quadrata che accoglie un pregevole coro formato da un a serie di scranni in legno finemente intagliati.

L’impianto strutturale è in muratura portante di mattoni mista a pietrame. l’interno come anche il portico sono tinteggiati mentre i finanche ed anche l’esterno dell’abside sono a faccia vista. La copertura interna dell’intera chiesa è formata da volte a crociera, mentre esternamente è presente un tetto a doppia falda.

Attualmente vi risiede una piccola Fraternità parrocchiale.