Questo Convento ebbe il suo attestato di nascita con la bolla di Sisto IV del 10 aprile 1481.

Agostino da Stroncone in “Umbria Serafica” affermava: “L’Osservanti alla fratta di Perugia… ottengono quest’anno (1481) dal Papa di trasferirsi a Mercatale, la chiesa però, col titolo di S. Maria della Pietà, la fa a sue spese Bartolomeo Burelli di Nello della Fratta, cittadino di Perugia”.

Con la soppressione italiana nel 1863 il convento fu indemaniato e, dopo molte vicissitudini, nel 1941 fu affidato ai salesiani, i quali, insieme alla Parrocchia, gestirono anche l’Oratorio “Don Bosco”. Vi rimasero fino al 1963. Il 4 gennaio 1964 vi rientrarono i Frati Minori. 

Molte le trasformazioni operate in questi ultimi anni per riportare il Convento e la chiesa alle loro origini. 

Fraternità parrocchiale e Cappellania Ospedale locale.